البته، هر سکه‌ای دو رو دارد. درنتیجه، اتوماسیون رباتیک دارای معایب و محدودیت‌هایی نیز می‌باشد. هر رباتی را نمی‌توان برای هر نوع برنامه‌ای استفاده کرد.

• ربات‌ها جایگزین کارگران انسانی خواهند شد، که باعث بروز مشکلات اقتصادی، نارضایتی و رنجش کارگران گشته و از طرفی نیازمند بازآموزی نیروی کار متخصص هستند.
• ربات‌ها فاقد قابلیت پاسخگویی در مواقع اضطراری هستند؛ مگر اینکه وضعیت، پیش‌بینی‌شده باشد و پاسخ از قبل در سیستم، گنجانده شود. اقدامات ایمنی بسیاری در این راستا لازم است؛ تا اطمینان حاصل شود که آن‌ها به اپراتورها و سایر ماشین‌هایی که با آن‌ها کار می‌کنند؛ آسیب نرسانند. این موارد شامل:

– پاسخ‌های نامناسب یا اشتباه

– نداشتن قدرت تصمیم‌گیری

– ازدست دادن توان

– آسیب به ربات و سایر دستگاه‌ها

– صدمات وارده به انسان

• ربات‌ها، اگرچه از جهاتی برتر هستند؛ اما قابلیت‌های محدودی در موارد زیر دارند:

– درجات آزادی و مهارت

– سنسورها و سیستم‌های بینایی

– پاسخ زمان-دقیق (real-time)

• ربات‌ها به دلایل زیر، هزینه‌بر هستند:

– هزینه اولیه تجهیزات و نصب

– نیاز به ادغام در فرآیندهای تولید

– نیاز به وسایل جانبی

– نیاز به آموزش

– نیاز به برنامه‌نویسی

به‌علاوه، ربات‌ها را می‌توان توسط تعداد کمی از متخصصان (دوباره) برنامه‌نویسی کرد. به‌طور متوسط، هر برنامه‌نویس، با دو زبان برنامه‌نویسی آشنایی دارد و اگر شرکت شما، بیش از یک نوع ربات داشته‌باشد؛ این امر ممکن است؛ هزینه‌های بیشتری را به همراه داشته ‌باشد.